28 февраля 1938 года детская медицинская служба в Ленинском районе Решением городского совета депутатов трудящихся №535 была выделена в самостоятельную детскую консультацию №6. Детская консультация располагалась в одноэтажном деревянном доме по ул. Серова,102, в ней работали 5 медицинских работников: 1 врач, 3 медицинские сестры и 1 санитарка. Обслуживали детей в возрасте до 7 лет всего Ленинского района, а с 1950 года стали обслуживать всех детей в возрасте до 17 лет.
16 января 1953 года детская консультация была реорганизована в Детскую больницу Ленинского района, имеющую в своем составе поликлинику на 13 педиатрических участков и стационар на 50 коек, который располагался по ул. Серова,39.
В больнице работало 17 врачей, медицинская помощь оказывалась по 4 специальностям.
В 1957 году в Детской больнице Ленинского района организован филиа в поселке им. Свердлова на ул. Крымской в бараке, где располагалось 4 педиатрических участка. Общее количество доведено до 18 с численностью детей на одном участке 1000 человек.
С 1959 года данный филиал был переведен из барака во вновь построенное деревянное здание по ул. Ульянова,9, где он и просуществовал до 1965 года.
23 августа 1960 года решением исполкома Омского городского Совета депутатов трудящихся №21/7 Детская больница Ленинского района была переименована в Детскую больницу №14.
В связи с тем, что материально-техническая база стационара Детской больницы №14, расположенного по ул. Серова,39 не отвечала санитарно-техническим требованиям 21 августа 1961 года он был переведен в новое здание по ул. Серова,37, которое строилось под военкомат. В данном стационаре было развернуто 85 педиатрических коек.
В 1965 году поликлиника Детской больницы №14 из старого здания на ул. Серова,102 была переведена в помещение вновь построенного пятиэтажного жилого дома по ул. К. Маркса,80, первый этаж которого реконструировали под детскую поликлинику.
В 1976 году по ул. Вильямса, 26а Омским телевизионным заводом было введено в строй новое здание детской поликлиники, которое в декабре 1988 года было выведено из состава Детской больницы №14 и введено в состав поликлиники телевизионного завода (Городская поликлиника №3).
В 1979 году улучшились условия размещения поликлиники детской больницы №14 на ул. К. Маркса,80 за счет реконструкции 2 этажа жилого дома под поликлинику.
В январе 1984 года после ввода поликлиники №10 по ул. Моторная,7 в микрорайоне Московка-2, туда было передано на обслуживание 13 врачебный участков из 41 имеющегося.
01 января 1986 года Детская больница №14 решением Омского городского Совета народных депутатов №15 от 29.03.1985г. была переименована в Детскую городскую больницу №6.
01 января 1993 года на основании Постановления администрации г. Омска №871 от 18.12.1992 г. Детская городская больница №6 была реорганизована в Детскую городскую поликлинику №6.
15 февраля 1996 г. Детская городская поликлиника №6 была зарегистрирована как «Муниципальное учреждение здравоохранения Детская городская поликлиника №6» (далее МУЗ «ДГП №6») на основании Постановления регистрационной палаты администрации г. Омска №482 от 15.02.1996г.
В июле 1997 года МУЗ «ДГП №6» передано вновь построенное здание площадью 2000 кв.м. по ул. С. Стальского,6, где были развернуты отделения лучевой диагностики, лаборатория, отделение восстановительного лечения.
С 1 марта 2002 года на основании приказа Управления здравоохранения г. Омска №153 от 28.02.2002 в состав МУЗ «ДГП №6» вошла детская поликлиника отделенческой железнодорожной больницы на ст. Омск. Было передано здание поликлиники площадью 1500 м2 по адресу: ул. Карбышев,20 с оборудованием. Детское население 7,5 тыс. чел., обслуживаемых на 10 врачебных участках.
В целях приближения медицинской помощи детскому населению с 01.01.2003 – 2,4 тыс. детей было передано на обслуживание в детские поликлиники Октябрьского и Центрального округов.
С 03 февраля 2003 года в связи с передачей на основании приказа Управления здравоохранения №63 от 31.01.2003 года на медицинское обслуживание в муниципальное здравоохранение детей, наблюдающихся в железнодорожной поликлинике пос. Входной в состав МУЗ «ДГП №6» вошли 2 врачебных участка пос. Входной с численностью детского населения 1,6 тыс. чел.
12 января 2012 г. Муниципальное учреждение здравоохранения «Детская городская поликлиника №6» переименовано в бюджетное учреждение здравоохранения Омской области «Детская городская поликлиника № 6» (БУЗОО «ДГП № 6») на основании распоряжения Правительства Омской области от 2 ноября 2011 года №152-рп «О безвозмездной передаче в собственность Омской области учреждений здравоохранения, находящихся в собственности муниципальных образований Омской области», распоряжения Министерства здравоохранения Омской области об отверждении новой редакции устава от 26 декабря 2011 года № 539-р.
В настоящее время поликлиническая помощь детскому населению оказывается в помещениях БУЗОО «ДГП №6», расположенных по адресам: пр. К. Маркса,80, ул. Карбышева,20, ул. С.Стальского,6, мкр. Входной, д.22 корп.1.