В течении 25 лет поликлиническое отделение возглавляла Стецун Валентина Филтпповна (1981-2006 гг.). С 2006 года в штатное расписание учреждения введена должность заместителя главного врача по поликлинической работе и назначена Веселовская Людмила Алексеевна (2006-2023 гг.). С 2023 года назначена на должность заместителя главного врача по поликлинической работе Никитина Наталья Леонидовна.
В 1973 году на базе поликлиники № 1 был открыт травматологический пункт, для оказания неотложной травматологической помощи пострадавшим детям Советского административного округа, части детского населения Центрального административного округа и Омского района Омской области.
      В 1970 году открыта поликлиника №2 на 70 посещений в смену. Первым заведующим поликлиники была назначена Мананникова Алла Александровна (1970-1973 гг.). В последующие годы - Малкова Наталья Васильевна (1973-1976 гг.); Афонина Раиса Михайловна (1976-1992 гг.); Шиманская Зоя Львовна (1993-2008 гг.); Кудренко Сергей Сергеевич (2009); Нефёдова Татьяна Герасимовна (2010); Мирошниченко Раиса Герасимовна (2011-2015 гг.); Никитина Наталья Леонидовна (2015-2023 гг.). С 2023 года и по настоящее время поликлинику возглавляет Витке Дарья Владимировна.

          В 2009 году на базе поликлиники № 2 открыт кабинет медико-социальной помощи по реализации социальных мероприятий и активной медицинской помощи детям из семей медико-социального риска.
          В 2018 году на базе поликлиники №2 БУЗОО “ГДКБ №3” открыт выездной кабинет паллиативной медицинской помощи в целях улучшения качества оказания медицинской помощи детям с неизлечимыми заболеваниями.
      В 1985 году открыта поликлиника №3 с функциями осуществления восстановительного лечения для оздоровления детей с отклонениями в состоянии здоровья с периода новорожденности до 18-ти лет (в составе кабинетов: физиотерапевтических, массажа, лечебной физкультуры, водолечения). Первым заведующим поликлиникой №3 была Синюгина Раиса Ивановна (1985-1987 гг.), в последующие годы - Зелинская Валентина Петровна (1987-1989 гг.), Петрова Тамара Степановна (1989-1995 гг.), Веселовская Людмила Алексеевна (1995-1997), Телятников Алексей Викторович (1997-2003 гг.), Зюзько Сергей Сергеевич (2003-2005 гг.), Бажина Ирина Владимировна (2005-2007 гг.). С 2007 года и по настоящее время поликлинику возглавляет Калугина Елена Александровна.

1.Отделения неотложной и плановой хирургии на 60 коек. Первым заведующим отделением была Сваровская Татьяна Леонидовна (1963-1970 гг.), в последующие годы: Олейник Алина Николаевна1970-1975 гг.), Кудренко Сергей Кириллович (1975-1988 гг.), Еремина Галина Павловна (1988-1992 гг.), Халалеев Валентин Николаевич (1992-2014гг.). С 2014 года по настоящее время заведующий хирургическим отделением №1-врач-детский хирург Игнатчик Сергей Владимирович.
2.Отделения гнойной хирургии на 60 коек, в том числе 20 коек торакального профиля организованого в 1972 году. Первым заведующим была Григорьева Галина ивановна (1972-1974 гг.). В последующие годы отделением заведовали: Федотова Маргарита Александровна 91974-1979 гг.), Лысов Анатолий Васильевич 91979-1981 гг.), Овсянкин Александр Георгиевич (1981-1994 гг.), Кишков Анатолий владимирович (1994-2011 гг.). С 2011 года по настоящее время заведующий хирургическим отделением №3-врач-детский хирург Кугаевских Владимир Николаевич.
3.Отделения детской травматологии-ортопедии на 40 коек открытого в 1976 году под руководством Мухаметовой Фариды Сабировны.В последующие годы отделением руководили: Шевчук Виктор Ильич (1976-1980 гг.), Пироженко Владимир Васильевич (1980-1983 гг.), Злобин Борис Борисович (1983-2014 гг.), Степанов Михаил Анатольевич (2014-2023 гг.).  С 2023 года по настоящее время заведующий травматолого-ортопедическим отделением-врач-травматолог-ортопед Перфилов Максим Александрович.

      В 1978 году в составе коечного фонда хирургического стационара больницы было организовано отделение анестезиологии – реанимации и интенсивной терапии на 6 коек, первое в городе Омске и Омской области специализированное детское отделение данного профиля.
      В 1987 году в ведение больницы передано новое 7-ми этажное здание, в котором был развернут хирургический стационар на 320 коек с переводом всех детских хирургических коек из стационаров общей лечебной сети. Были организованы: отделение неотложной хирургии на 90 коек,травматолого-ортопедическое отделение на 90 коек; отделение плановой хирургии на 60 коек. В 1988 году под руководством Разливинских Лидии Николаевны основано отделение плановой хирургии и урологии на 40 коек. В последующие годы отделением руководили: Зайцев Юрий Егорович (2001-2005 гг.), Лямзин Сергей Иванович (2005-2016 гг.), Черкасов Александр Георгиевич (2016-2024 гг.). С 2024 года по настоящее время заведующий хирургическим отделением №2-врач-детский хирург Кишкин Вячеслав Ренальевич.
      В ходе развития больницы проводились неоднократные изменения по коечному фонду стационаров, стабилизировались приоритетные направления специализированной медицинской помощи; проведено дальнейшее расширение отделения анестезиологии-реанимации до 24 круглосуточных коек. В 1993 году в составе хирургического стационара дополнительно развернуто нейрохирургическое отделение на 60 коек. Первым заведующим был Ларькин Валерий Иванович (1993-2008 гг.). В последующие годы отделением руководил Мишкин Владислав Васильевич (2008-2024 гг.). С 2024 года по настоящее время заведующий нейрохирургическим отделением - врач-нейрохирург Коваль Руслан Павлович.

     С 2009 года учреждение имеет лицензию на право оказания высокотехнологичной медицинской помощи и осуществляет высокотехнологичную медицинскую помощь по 5-ти разделам детской хирургии: абдоминальная хирургия, нейрохирургия, детская урология-андрология, травматология-ортопедия, торакальная хирургия.
В 2019 году завершена реконструкция корпуса №1 хирургического стационара, с вводом в эксплуатацию здания корпуса №1 в состав хирургического стационара БУЗОО «ГДКБ №3» в августе 2019 года переведены из БУЗОО «Городская больница №3» детские отделения оториноларингологии (на 45 коек), заведовала отделением Калугина Юлия Кирилловна (2019-2023 гг.), с 2023 год по настоящее время заведующий оториноларингологическим отделением - врач-оториноларинголог Павлова Надежда Александровна и челюстно-лицевой хирургии (на 45 коек), заведовал отделением Вардугин Сергей Юрьевич (2019-2022 гг.),с 2022 год по настоящее время заведующий отделением челюстно-лицевой хирургии - врач-челюстно-лицевой хирург Проняев Евгений Александрович.

В 1980 году - нефрологическое отделение на 30 коек, которое в 1992 году расширено до 60 коек. Первым заведующим отделением была Беззубова Людмила Ивановна (1980-1984 гг.). В последующем - заведующие отделением: Кораблёва Ольга Александровна (1984-2007 гг.), каява Ольга Валентиновна (2007-2009 гг.), Шиманская Вера Васильевна (2009-2012 гг.), Прохорова Татьяна Александровна (2012-2023 гг.).С 2023 года по настоящее время заведующий нефрологическим отделением-врач-нефролог Бахтина Ирина Васильевна.
В 1990 году - гастроэнтерологическое отделение на 40 коек. Первый заведующий гастроэнтерологическим отделением Приходченко Валентина Кирилловна (1990-1992 гг.). С 1992 года по настоящее время заведующий гастроэнтерологическим отделением-врач-гастроэнтеролог высшей квалификационной категории Генык Лилия Ивановна.
          Неврологическое отделение для детей с органическим поражением центральной нервной системы и нарушением психики в составе «ГДКБ №3» ведет свою историю с 1978 года в составе «Детской психиатрической больницы». Основателем неврологического отделения является врач-невролог высшей квалификационной категории Линевич Валентина Тимофеевна (1978-2004 гг.)
          В 2005 году, в состав педиатрического стационара "ГДКБ №3" было переведено неврологическое отделение для детей с органическими поражениями центральной нервной системы и нарушением психики на 60 коек, в связи с реорганизацией муниципального учреждения здравоохранения города Омска «Детская психиатрическая больница».
          Заведующим неврологическим отделением «Городской детской клинической больницы 3» стала врач-невролог высшей квалификационной категории Лопатина Ольга Викторовна (2005-2020 гг.). В последующем - заведующие отделением: Толкачев Иван Викторович (2020-2022 гг.), Яковлева Наталья Николаевна (2022 г.). С 2023 года по настоящее время заведующий неврологическим отделением-врач-невролог Мартыненко Екатерина Игоревна.

В 1995 году “Детская городская больница № 18” переименована в Муниципальное учреждение здравоохранение “Городская детская клиническая больница №3”.

1.Отделения воздушно-капельных инфекций на 36 коек. С открытия отделения первым заведующим была Винокурова Любовь Сергеевна (1964-1981 гг.). В последующие годы – заведующие: Чернова Людмила Михайловна (1981-1989 гг.), Огородникова Людмила Борисовна (1989-1993 гг.), Гранкина Галина Владимировна (1993-2019 гг.), Жойдик Светлана Николаевна (2019-2021 гг.). С 2021 года по настоящее время заведующий инфекционным отделением №1 – врач-педиатр Голованова Наталья Владимировна.
2.Отделения нейроинфекций на 37 коек. С открытия отделения первым заведующим была Чернова Людмила Михайловна (1989-1992 гг.). В последующие годы – заведующие Раздьяконова Наталья Марьяновна (1992-2002 гг.), Зыкова Татьяна Анатольевна (2002-2010 гг.), Булавина Ольга Владимировна (2010-2024 гг.). С 2024 года по настоящее время заведующий инфекционным отделением №2 – врач-педиатр Фадюшина Екатерина Александровна.
3.Отделения стенозирующих ларинготрахеитов на 37 коек. Первым заведующим отделения до 1995 года была Колесникова Раиса Ахметовна. В последующие годы – заведующие Безрукова Людмила Алексеевна (1995-2005 гг.), Шефер Екатерина Петровна (2005-2020 гг.). С 2021 года по настоящее время заведующий инфекционным отделением №3 – врач-педиатр Жойдик Светлана Николаевна.
4.отделения реанимации и интенсивной терапии на 6 коек.

         Со дня основания больницы ведут свою историю диагностические и вспомогательные отделения: клинико-диагностическая лаборатория, рентгеновское и физиотерапевтическое отделения, централизованная стерилизационная; с последующей организацией отделений функциональной диагностики, эндоскопической и ультразвуковойдиагностики. В 2006 году в составе рентгеновского отделения больницы открыт кабинет магнитно-резонансной томографии, работающий в круглосуточном режиме.

      В 2012 году Муниципальное учреждение здравоохранения “ГДКБ №3” переименовано в Бюджетное учреждение здравоохранения Омской области “Городская детская клиническая больница №3”.

В настоящее время Бюджетное учреждение здравоохранения Омской области "Городская детская клиническая больница № 3" является крупнейшим детским многопрофильным учреждением здравоохранения на территории Западной Сибири в составе трех профильных стационаров с коечным фондом на 619 круглосуточных коек:
- хирургического на 392 коек;
- педиатрического на 117;
- инфекционного на 110 коек
и поликлинического отделения в составе 3 амбулаторных подразделений на 300 посещений в смену.
       БУЗОО "Городская детская клиническая больница №3" в соответствии с лицензией осуществляет медицинскую деятельность:
 - по 20 видам первичной доврачебной, врачебной и специализированной медико-санитарной помощи в амбулаторных условиях территориальному детскому населению Советского административного округа города Омска;
   - по 17 видам стационарной специализированной медицинской помощи детскому населению города Омска и Омской области;
      - по 10 видам диагностических и вспомогательных медицинских услуг.
      БУЗОО «ГДКБ №3» ежедневно оказывает в круглосуточном режимевысококвалифицированную неотложную медицинскую помощь, консультативно – диагностическую и плановую медицинскую помощь детскому населению города Омска, Омской области, иногородним детям и жителям других государств и первичную доврачебную, врачебную и специализированную медико-санитарную амбулаторную помощь территориальному детскому населению.
Поликлинической отделение представлено двумя территориальными поликлиниками №1 и №2 на 300 посещений в смену и поликлиникой №3 восстановительного лечения.

 В поликлинике осуществляется прием территориального населения по 16 врачебным специальностям, проводятся консультативные приемы по ряду специальностей для детей города Омска и Омской области. Поликлиника работает в условиях преемственного взаимодействия в системе единого амбулаторно-стационарного комплекса БУЗОО «ГДКБ №3», что позволяет оптимально использовать возможности единого учреждения в части современной диагностической, консультативной и специализированной медицинской помощи. Все кабинеты поликлиники компьютеризированы и функционируют в составе единой локальной сети. С 2012 года введена в действие электронная регистратура, создана доступная система записи на прием к специалистам.
 В 2023 году организована Школа для больных сахарным диабетом в целях организации оказания медицинской помощи детям, в амбулаторных условиях в виде группового терапевтического обучения больных сахарным диабетом по структурированным программам в зависимости от типа сахарного диабета и метода лечения, с обязательной практической отработкой навыков, необходимых для самостоятельного управления заболеванием.

 В 2018 году на базе поликлиники №2 БУЗОО “ГДКБ №3” открыт выездной кабинет паллиативной медицинской помощи в целях улучшения качества оказания медицинской помощи детям с неизлечимыми заболеваниями. В 2021 году выездной кабинет паллиативной медицинской помощи реорганизован в отделение выездной патронажной паллиативной медицинской помощи в целях улучшения организации оказания паллиативной специализированной медицинской помощи детям, в амбулаторных условиях. Отделение выездной патронажной помощи включает в себя выездную патронажную бригаду.

Основными задачами Центра здоровья являются:
-своевременная оценка функциональных и адаптационных резервов детского организма;
-профессиональное консультирование по вопросам сохранения и укрепления здоровья детей, включая рекомендации по коррекции питания, двигательной активности, режиму и условиям быта, учебы и отдыха.
За период работы в Центре здоровья обследовано более 80 тыс.детей, которым даны рекомендации по здоровому образу жизни, коррекции питания, режиму дня. При необходимости врачи-специалисты рекомендуют ребенку динамическое наблюдение в Центре здоровья с проведением повторных исследований в соответствии с выявленными факторами риска.
 В 2012 году организован дневной стационар неврологического и травматолого-ортопедического профилей по 10 коек дневного пребывания.
 В поликлиническом отделении сложилась система единого взаимодействия врачей-педиатров участковых, Центра здоровья и кабинета медико-социальной помощи с позитивными результатами оказания медицинской помощи и социальной помощи отдельным группам детей.
Стационарный комплекс учреждения представлен 4-мя стационарами с коечным фондом на 619 круглосуточных коек.

В гастроэнтерологическом отделении педиатрического стационара проводятся диагностические и лечебные мероприятия детям с хроническим заболеванием пищеварительной системы, с широким использованием физиотерапевтического лечения, лечебного массажа, лечебной физкультуры. В практической деятельности отделения освоена и успешно проводится методика коррекции расстройства питания у детей раннего возраста путем поэтапного лечебного питания смесями различного состава детям до года и 5-разового лечебного питания детям старше года. Широко применяется современный метод лечения воспалительных заболеваний кишечника-моноклональными антителами.
 Неврологическое отделение педиатрического стационара оказывает специализированную неврологическую помощь детям города Омска и Омской области с органическим поражением центральной нервной системы и нарушением психики. Наибольшее количество пациентов неврологического отделения составляют дети с эпилепсией; гидроцефалией с выраженной гипертензией, не требующей хирургической коррекции; детским церебральным параличом; прогрессирующими и другими прогредиентными заболеваниями, в том числе рассеянным склерозом. С 2023 года в неврологическом отделении внедрена методика лечения аутоиммунных энцефалитов моноклональными антителами. Дополнительно в комплекс лечебных мероприятий по показаниям включаются: массаж, лечебная физкультура, физиотерапевтические процедуры, логопедическая и психологическая коррекция.
 Нефрологическое отделение педиатрического стационара оказывает специализированную диагностическую, консультативную и лечебную помощь детям, страдающим заболеваниями органов мечевыделительной системы в возрасте от 1 месяца до 17 лет, в том числе с тяжелыми формами гломерулонефритов, гемолитикоуремическим синдромом, хронической почечной недостаточности. Диагностические возможности клиники обеспечивают полный объем исследований, необходимый пациентам нефрологического профиля.

 Инфекционный стационар, единственный в городе, располагает 8 мельцеровскими боксами и 3 полубоксами для изоляции больных с острозаразными инфекциями и сыпью неясного генеза. Все отделения стационара работают в круглосуточном режиме и оказывают неотложную медицинскую помощь детскому населению города Омска и Омской области. Основным профилем стационара являются воздушно-капельные инфекции детского возраста, более 20 нозологических форм. Инфекционный стационар располагает клинической, биохимической и бактериальной лабораториями, рентгеновским кабинетом. Многие годы инфекционный стационар является базой кафедры детских инфекционных болезней Омского государственного медицинского университета.
 В инфекционном отделении №1 осуществляется лечение долее 20 нозологических форм воздушно-капельных инфекций. В отделении проводится широкий спектр современных диагностических исследований: биохимических, микробиологических, вирусологических,  серологических, инструментальных.
 В инфекционном отделении №2 проводится диагностика и лечение детей с менингококковой инфекцией, гнойными и вирусными менингитами, клещевыми энцефалитами, боррелиозами, внутриутробными инфекциями с нарушениями центральной нервной системы и другими нейроинфекциями, вызванными бактериальной и вирусной флорой.
 В инфекционном отделении №3 оказывают лечебно-диагностическую помощь пациентам с острыми респираторными заболеваниями, осложненными обструктивным ларингитом, стенозом гортани, обструктивным бронхитом, пневмонией.
Коллектив инфекционного стационара совместно с сотрудниками кафедры детских инфекционных болезней Омского государственного медицинского университета подготовили в 2024 году ряд научных статей:
1.Л.В. Пузырёва, Е.А. Гашина, Л.Н. Пайманова, Н.В. Голованова, Е.П. Шефер, Н.А. Сабаева. Клинико-диагностические особенности коклюша у детей в городе Омске. Иммунология, аллергология, инфектология. 2024, №3:13-18
2.Л.В. Пузырёва, В.И. Ларькин, В.В. Мишкин, С.Г. Пимов, Е.П. Шефер, Л.Н. Пайманова, Е.А. Гашина, Н.А. Сабаева. Церебральные нарушения как осложнение коклюша у ребёнка до года. Детские инфекции.2024, 23(4)).
По итогам работы в условиях пандемии новой коронавирусной инфекции Covid-19 опубликовано 3 статьи в журнале «Детские инфекции»:
1. Белан Ю.Б., Гашина Е.А., Лобова Е.Ф., Шефер Е.П. Клинический случай развития мультисистемного воспалительного синдрома у ребенка с новой коронавирусной инфекцией. Детские инфекции. 2021; 20(2):60-63. doi.org/10.22627/2072-8107-2021-20-2-60-63 (перечень ВАК №904 от 28.12.2018)
2. Белан Ю.Б., Гашина Е.А., Лобова Е.Ф., Безрукова Л.А. Коронавирусная инфекция у детей в Омской области. Детские инфекции. 2020; 19(4):30-33. doi.org/10.22627/2072-8107-2020-19-4-30-33 (перечень ВАК №860 от 28.12.2018)
3. Гашина Е.А., Лобова Е.Ф., Шефер Е.П. Клинический случай новой коронавирусной инфекции с поражением сердца у ребенка. Детские инфекции. 2022; 21(3):52-55. doi.org/10.22627/2072-8107-2022-21-3-52-55 (перечень ВАК №904 от 28.12.2018)

Хирургический стационар в настоящее время функционирует в количестве 392 койки и составе 2-х приемных отделений и 9-ти специализированных отделений:
-хирургическое отделение №1 (отделение неотложной хирургии), на 72 койки;
-хирургическое отделение №2 (отделение плановой хирургии), на 55 коек, в том числе 36 коек по профилю детской урологии-андрологии;
-нейрохирургическое отделение на 42 койки;
-травматолого-ортопедическое отделение на 72 койки;
-отделение гнойной хирургии на 43 койки, в том числе 10 коек торакального профиля;
-отделение челюстно-лицевой хирургии на 42 койки;
-отделение оториноларингологии на 42 койки;
-отделение анестезиологии-реанимации на 30 коек, обеспечивающее деятельность 9-ти операционных залов, 8-ми перевязочных, 1-го эндоскопического кабинета.
С 2009 года в лечебном учреждении детскому населению г. Омска и омской области оказывается высокотехнологичная медицинская помощь по 5-ти разделам детской хирургии:
-нейрохирургия;
-детская урология;
-травматология-ортопедия;
-торакальная хирургия;
-челюстно-лицевая хирургия.
Ежегодно в хирургическом стационаре проводится более 8 тысяч оперативных вмешательств, в том числе более 300 эндоскопических операций. Совершенствуются традиционные, осваиваются и внедряются инновационные методики лечения во всех отделениях хирургического стационара. Освоены и внедрены в практическую деятельность клиники 85 инновационных методов обследования и лечения пациентов и более 20 видов оперативных вмешательств с применением высоких медицинских технологий. Проведено более 3 тысяч операций с применением высоких медицинских технологий. Врачи-специалисты стационара активно занимаются научно-практической деятельностью, успешно сочетают практическую работу с научной. Разработано и зарегистрировано в установленном порядке 13 патентов на рационализаторские предложения по лечению заболеваний пациентов детского возраста и приборы медицинского назначения. Среди работающих врачей 11 кандидатов медицинских наук; 30% врачебного состава имеют сертификаты по 2-м и более специальностей. Высокий профессиональный уровень клиники является результатом плодотворного сотрудничества врачебного коллектива с кафедрами Омского государственного медицинского университета. Оснащенность стационара новой техникой, диагностической аппаратурой позволяет осуществлять различные диагностические исследования на высоком уровне.
         Хирургическое отделение №1 (отделение неотложной хирургии) функционирует на 72 койках и осуществляет оказание неотложной хирургической помощи больным детям с патологией органов брюшной полости. Врачи-детские хирурги отделения одни из первых в клинике освоили и успешно проводят эндоскопические операции, ежегодное число которых составляет более 300. Проводятся лапароскопические операции по устранению паховых грыж, аппендэктомии.
        Хирургическое отделение №2 (отделение плановой хирургии и урологии) функционирует на 55 койках, в том числе 36 коек по профилю детской урологии-андрологии. В отделении успешно проводятся плановые операции по устранению варикоцеле, паховых грыж, пузырно-мочеточниково-почечного рефлюкса и других заболеваний с использованием малоинвазивных эндоурологических методик, что практически исключает необходимость проведения традиционных операций при данной патологии, уменьшает сроки послеоперационного пребывания пациентов в стационаре и сроки их выздоровления. Для диагностики и лечебных целей в отделении имеются: процедурный кабинет, перевязочная, цистоскопический кабинет, блок функциональных исследований, физиокабинет. В отделении освоены и широко применяются малоинвазивные эндоскопические методики - эндоскопической коррекции пузырно-мочеточникового рефлюкса у детей. Внедрены передовые методики оперативных вмешательств при гипоспадии у детей. Проводятся лапароскопические пластики пиелоуретерального сегмента при гидронефрозе. Проводятся лапароскопические операции по устранению паховых грыж, аппендэктомии.
         Хирургическое отделение №3 (отделение гнойно-торакальной хирургии) функционирует на 43 койках, в том числе 10-ти коек торакального профиля. В отделении с успешными результатами проводится лечение пациентов с гнойными и врожденными заболеваниями органов дыхания, средостения, перикарда, костно-мышечной системы (острых и хронических остеомиелитов, артритов различной этиологии), заболеваний кожи и подкожной клетчатки. В отделении внедрены и проводятся операции по устранению пилонидальных кист. Торакоскопические операции по удалению опухолей средостения, резекции легкого при буллезной болезни легких, санация плевральных полостей при фибринотораксе. Проводятся операции по устранению килевидной деформации грудной клетки.
          Травматолого-ортопедическое отделение функционирует на 72 койках, осуществляет все виды консервативного и оперативного лечения повреждений, заболеваний и аномалий развития опорно-двигательного аппарата пациентам детского возраста. С позитивными результатами проводятся консервативное и хирургическое лечение повреждений и врожденных заболеваний позвоночника. Выполняются методики чрезкостного и накостного остеосинтеза при лечении повреждений и заболеваний длинных трубчатых костей с использованием рентгеновской аппаратуры.
          Нейрохирургическое отделение функционирует на 42 койках и является единственным специализированным высококвалифицированным отделением на территории города Омска и Омской области по оказанию нейрохирургической помощи детскому населению с травмами, заболеваниями и пороками развития нервной системы. Приоритетными направлениями нейрохирургического отделения являются нейротравматология, нейроонкология, неонатальная нейрохирургия,      Нейрохирургические операции проводятся пациентам с периода новорожденности. Успешно проводятся малоинвазивные оперативные вмешательства с применением высоких медицинских технологий в сочетании с применением метода нейронавигации и компьютерной волюметрии. Эффективные результаты достигнуты при выполнении реконструктивных операций у детей с последствиями черепно-мозговой травмы. Освоены новые методики по пластике дефекта черепа титановой пластиной. Выполняется практически весь спектр хирургических операций при онгкологических заболеваниях головного и спинного мозга. При необходимости проводятся телемедицинские консультации с ведущими специалистами НИИ нейрохирургии имени Н.Н. Бурденко.
          Оториноларингологическое отделение функционирует на 42 койках, осуществляет оказание неотложной и плановой помощи больным детям с патологией ЛОР-органов. Отделение осуществляет все виды консервативного и оперативного лечения патологии носа и его придаточных пазух, носоглотки, ротоглотки, гортани, наружного, среднего и внутреннего уха, вестибулярного анализатора.
          Отделение челюстно-лицевой хирургии функционирует на 42 койках, осуществляет оказание неотложной и плановой помощи больным детям с травмами мягких и твёрдых тканей челюстно-лицевой области, головы, шеи (переломы верхней и нижней челюсти, костей носа, скуловых костей, стенок глазниц.), врождёнными черепно-лицевыми пороками развития, такие как расщелина губы и неба, косые расщелины лица, доброкачественными новообразованиями головы и шеи (кисты, опухоли), хирургическое лечение и коррекция зубочелюстной деформации, прикуса. Успешно проводятся оперативные вмешательства с применением высоких медицинских технологий – уранопластика при пороках развития лицевого скелета.
 
В учреждении работает система ведомственного и вневедомственного контроля качества медицинской помощи, регулярно проводятся мониторинги удовлетворенности пациентов доступностью и уровнем оказания медицинской помощи на всех этапах маршрутизации.  Среди основных видов деятельности БУЗОО «ГДКБ №3» главной является медицинская деятельность, которая складывается из оказания первичной специализированной медико-санитарной помощи (неотложная, плановая) в амбулаторных условиях, специализированной, в том числе высокотехнологичной в условиях стационара. Кроме того, проводится фармацевтическаядеятельность, разрешена деятельность, связанная с оборотом наркотических средств и психотропных веществ; деятельность, связанная с источниками ионизирующего излучения; организационно-методическая деятельность, разработка новых методов деятельности и лечения больных.